https://frosthead.com

Tardigrades Mencetuskan Kontroversi dan Pameran Sains dalam Tindakan

Tidak ada keraguan bahawa invertebrata akuatik mikroskopik yang dikenali sebagai tardigrades, babi lumut atau beruang air adalah pelik. Kritikan aneh yang menggemaskan dapat bertahan dalam ruang kosong, menahan pemusnahan oleh kemarau dan muncul hidup selepas pembekuan, antara lain yang lain. Satu kajian baru-baru ini menunjukkan bahawa tardigrades juga pencuri gen-bahawa genom mereka memegang lebih banyak DNA daripada tumbuh-tumbuhan, bakteria dan mikrob lain yang tidak berkaitan daripada binatang lain di Bumi, Rachel Nuwer baru-baru ini melaporkan untuk Smithsonian.com . Keupayaan itu mungkin menjelaskan mengapa tardigrades sangat berdaya tahan, kata penyelidik.

Tetapi kira-kira seminggu selepas pengumuman penemuan mengejutkan itu, kumpulan lain telah mencabar penemuan, laporan Ed Yong untuk The Atlantic . Semakin cepat dan cepat antara kedua-dua pasukan menunjukkan bagaimana responsif dan berpotensi mengubah diri sains boleh berada dalam era digital.

Kajian pertama, dari pasukan yang berpangkalan di University of North Carolina, melaporkan bahawa satu spesies tardigrade membawa sejumlah 6, 600 gen yang pada asalnya dimiliki oleh organisma dari kerajaan lain-kebanyakannya bakteria tetapi juga kulat, tumbuhan, virus dan archaea, dan diperoleh melalui proses yang dipanggil pemindahan gen mendatar. Penemuan tersebut bermakna genom Hypsibius dujardini terdiri daripada 17.5 peratus DNA asing, yang dilaporkan dalam Prosiding Akademi Sains Kebangsaan . Oleh kerana sesetengah gen asing terlibat dalam tindak balas tekanan organisma lain, para penyelidik mengesyaki bahawa mereka mungkin telah memberikan tardigrade dengan beberapa kebolehan tersendiri mereka sendiri untuk menghadapi keadaan yang melampau.

Walau bagaimanapun, kumpulan kedua dari University of Edinburgh juga menyusun spesies tardigrade yang sama dan mendapat keputusan yang sangat berbeza. Mereka penyelidik mendapati critter mempunyai antara 36 dan 500 gen dipindahkan secara horizontal - peratusan yang lebih kecil. Apabila kertas UNC dikeluarkan, keputusan Edinburgh masih belum diterbitkan, tetapi para penyelidik bergegas untuk menerbitkan penemuan mereka pada bioRxiv.org server preprint - sebuah laman web di mana manuskrip dapat diterbitkan sebelum mereka diserahkan kepada jurnal dan tinjauan rakan sebaya yang tipikal kajian saintifik.

Kumpulan Edinburgh mengesyaki bahawa kumpulan UNC mungkin "mengurai DNA dari bakteria yang hidup bersama dengan tardigrades dan, walaupun usaha terbaik mereka, telah menyalahkan gen-gen mikrob untuk gen tardigrade asli" menulis Yong. Tetapi bagaimana mungkin kumpulan pertama telah tersilap, jika memang mereka? Yong menjelaskan bahawa teknologi untuk genom urutan melibatkan mencincang DNA ke dalam kepingan kecil dan kemudian membaik semula bit menjadi gambar yang koheren. Sesetengah pencemaran dapat dengan mudah tergelincir, jadi para saintis berusaha untuk mencari tahu bit yang dimiliki oleh organisme yang mereka pelajari, bukannya mikroba yang berdekatan.

Kumpulan Edinburgh menyedari bahawa beberapa serpihan DNA jarang berlaku, berbanding serpihan lain. "Tidak ada cara, secara biologi, ini boleh menjadi sebahagian daripada genom yang sama, " kata pemimpin pasukan, Mark Blaxter, kepada Yong. Kumpulan itu membuat kesimpulan bahawa terdapat 500 gen dalam genom tardigrade yang mungkin berasal dari sumber lain, tetapi mereka hanya mempunyai bukti kuat untuk 36 daripadanya. Itu memberikan tardigrade satu bahagian yang lebih tipikal DNA asing untuk haiwan.

Dalam ulasan mengenai kertas terbaru, Thomas Boothby dan Bob Goldstein dari UNC menunjukkan bahawa mereka menyedari potensi masalah ini dan bekerja keras untuk memastikan ia tidak menjejaskan keputusan mereka - tetapi selalu ada kemungkinan untuk kesilapan. Mereka menambah bahawa mereka akan melakukan analisis tambahan sebelum membuat komen lanjut. Penyelidik juga berkata mereka menghargai keputusan pesaing mereka untuk menerbitkan hasil bercanggah mereka dengan cepat di bioRxiv.org .

Perasaan itu sama. Sujai Kumar dari pasukan Edinburgh memberitahu Yong bahawa jika kumpulan UNC tidak mengeluarkan data mereka dengan segera, ia akan menjadi lebih mencabar untuk kumpulan mereka. "Apa yang jelas adalah keupayaan sains baru yang luar biasa untuk membetulkan diri dengan cepat, " kata Blaxter kepada Yong. Apa yang mengambil hanya sembilan hari dalam kes ini akan mengambil masa beberapa bulan sebelum ini.

Pada masa ini, juri masih mengeluarkan berapa banyak genom tardigrade yang berasal dari sumber-sumber asing. Tetapi walaupun makhluk-makhluk kecil ini bukanlah pencuri gen, mereka mungkin menjadi pencuri utama untuk seketika lagi.

Nota editor: Artikel ini disunting oleh Rachel Nuwer, yang pada asalnya melaporkan penyelidikan tardigrade untuk Smithsonian.com.

Tardigrades Mencetuskan Kontroversi dan Pameran Sains dalam Tindakan