Indonesia adalah tempat kelahiran paleoantropologi profesional. Di Eropah pada pertengahan abad ke-19, saintis menemui spesies hominid yang sudah pupus buat kali pertama: Neanderthal. Sebenarnya, lebih tepat untuk mengatakan fosil Neanderthal ditemui oleh orang awam yang kemudiannya membawa mereka ke perhatian ahli anatomi terkenal. Tidak sampai 1890 seorang penyelidik pergi ke lapangan mencari tulang hominid. Eugene Dubois, seorang doktor perubatan Belanda, mengembara ke Indonesia, kemudian sebuah jajahan Belanda, untuk mencari nenek moyang manusia. Pada tahun 1891, dia menemui fosil Homo erectus dan membuat hominid memburu usaha yang betul-dan menjadikan Asia sebagai destinasi bagi paleoanthropologists.
Trinil: Penemuan Dubois berlaku di sekitar kampung Trinil di Jawa Tengah. Temu pertamanya adalah skullcap, kini dikenali hingga kini hingga 700, 000 hingga 1 juta tahun yang lalu. Tengkorak itu kelihatan seperti manusia, tetapi ia mempunyai tulang tebal, peluru berat dan dahi yang rendah. Setahun kemudian, pada tahun 1892, Dubois pulih tulang paha hampir lengkap yang kelihatan hampir moden. Dia memutuskan tulang kepunyaan spesies pupus yang "pautan hilang" antara kera dan manusia. Dia menamakan spesies Pithecanthropus erectus ("menegakkan manusia ape"). Kadang-kadang disebut Java Man, spesies hari ini disebut Homo erectus .
Ngandong: Para penyelidik Belanda menemui lebih banyak fosil H. erectus, yang mewakili 15 individu, di Jawa pada tahun 1930-an di dekat kampung Ngandong di Sungai Solo di Jawa. Sehingga baru-baru ini, paleoanthropologists menganggap tulang Ngandong mewakili populasi H. erectus yang sangat baru-baru ini. Pemikirannya mungkin sekira 30, 000 hingga 50, 000 tahun yang lalu, hominid ini mungkin sezaman Neanderthals dan manusia moden yang tinggal di Eropah dan Asia Barat. Tetapi kerja lapangan dan analisis dating baru-baru ini mencadangkan hominid Ngandong hidup jauh lebih awal, kadang-kadang antara 143, 000 dan 546, 000 tahun yang lalu.
Mojokerto: Pada tahun 1936, seorang pembantu yang bekerja dengan Penyiasatan Geologi Belanda menggali skullcap separa kanak-kanak berusia dua hingga tiga tahun di Jawa timur. Ahli pasukan Ralph von Koenigswald, ahli paleontologi Jerman, mengiktiraf tengkorak itu sebagai milik hominid awal, H. erectus . Walaupun lokasi yang tepat, dan oleh itu usia, fosil telah dipersoalkan dalam beberapa tahun kebelakangan ini, para saintis secara umumnya memikirkan tengkorak Mojokerto pada kira-kira 1.8 juta tahun yang lalu. Itu menjadikannya salah satu tulang hominid tertua yang pernah ditemui di luar Afrika.
Sangiran: Antara 1937 dan 1941, von Koenigswald menemui fosil H. erectus tambahan di lokasi Sangiran di Jawa Tengah. Penemuan ini termasuk tiga tengkorak parsial, rahang separa dan berpuluh-puluh gigi terpencil. Fosil-fosil ini, sejak lebih dari satu juta tahun yang lalu, membantu mengesahkan kesahihan status spesies H. erectus . Hari ini, pelancong boleh melawat tapak fosil, yang merupakan rumah kepada penggalian yang berterusan serta muzium.
Flores: Penemuan hominid paling terkini di Indonesia adalah kejutan besar. Pada tahun 2004, sekumpulan penyelidik dari Indonesia dan Australia mengumumkan bahawa mereka telah menemui koleksi fosil yang tidak biasa di pulau Flores di Indonesia. Tulang milik seorang hominid kecil yang kurang dari empat kaki dan ditimbang kurang dari 70 paun-namun beberapa fosil hanya berumur 17, 000 tahun. Para penyelidik memutuskan bahawa "Hobbit" tergolong dalam spesies baru, Homo floresiensis . Setelah keturunan spesies, mungkin H. erectus, tiba di pulau itu, hominid berkembang menjadi lebih kecil sebagai adaptasi untuk hidup di sebuah pulau kecil. Pengkritik, bagaimanapun, mengatakan Hobbit sebenarnya manusia moden dengan beberapa jenis penyakit pertumbuhan.
