https://frosthead.com

A Boston Biotech Company Is Engineering New Smells

Ginkgo Bioworks dikendalikan oleh penggodam. Walaupun mereka lebih suka mengatakan mereka "merancang organisma, " pekerja telah membina makmal, atau "pengecoran, " di Boston, di mana mereka menggodam biologi. Mereka menyusun gen, kemudian masukkan campuran gen ke dalam vial ragi, dengan cepat mengembangkan organisma sintetik yang memenuhi keperluan manusia .

Pengarah kreatif Gingko, Christina Agapakis, mengatakan bahawa mereka pada dasarnya sedang mempercepat evolusi. "Ia seperti kilang prototaip yang cepat, " katanya.

Para biohackers sedang berusaha untuk membina organisma yang menangkap karbon dan yang lain yang membiak probiotik yang membantu orang melawan jangkitan. Syarikat itu menerima pembiayaan awal dari DARPA untuk membangunkan syarikat itu. Tetapi sekarang, Gingko mencipta organisma yang memancarkan bau tertentu. Matlamatnya adalah untuk menghasilkan banyak aroma dan rasa sintetik yang boleh digunakan untuk segala-galanya dari minyak wangi hingga pemanis tiruan. Ia adalah satu langkah yang berpotensi untuk menggantikan sebatian organik jarang, mahal, lambat atau tidak menentu. Robertet, sebuah syarikat haruman Perancis, menugaskan Gingko untuk membantu mensintesis aroma dari mawar tertentu, yang hanya ditanam di Turki dan Bulgaria, yang dipetik dengan tangan.

"Wangian telah menjadi petunjuk kerana wangian menggunakan kimia sesuatu yang bermula sebagai ekstrak biologi, " katanya. "Jadi, kita melihat di mana biologi boleh kembali ke kejuruteraan kimia dan menjadikannya lebih mampan dan boleh diperbaharui."

Saya baru-baru ini bercakap kepada Agapakis tentang syarikat dan misinya:

Bagaimanakah Ginkgo bermula?

Ginkgo telah ditubuhkan pada tahun 2008 oleh Tom Knight dan empat lelaki (Reshma Shetty, Jason Kelly, Barry Canton, Austin Ch) yang baru saja selesai mendapat PhD di MIT. Tom mempunyai tangan dalam membangunkan ARPANET, pendahulunya ke Internet, tetapi pada lewat 90-an, dia memutuskan komputer membosankan dan biologi pengaturcaraan menarik. Dia mahu melihat di mana kejuruteraan dan biologi berpotongan. Itulah titik Ginkgo. Pengasas ingin menjadikan biologi lebih mudah untuk jurutera, dan kemudian melihat apa yang dimaksudkan untuk industri dan teknologi.

Mengapa ia berlaku sekarang?

Apabila ia bermula pada tahun 2008, ia adalah kira-kira masa ketika kos urutan DNA benar-benar jatuh dengan cepat, dan kerana orang-orang itu memulakan penjujukan segala-galanya. Pengetahuan mengenai bagaimana evolusi telah menyelesaikan masalah telah berkembang dengan pesat, dan orang telah menjejaki pelbagai jenis genom dan enzim. Ia telah menjadi sumber atau perpustakaan.

Sisi lain adalah sintesis. Anda sudah biasa mencari organisma, dan sekarang anda boleh mensintesis gen dari pangkalan data. Apabila saya seorang pelajar, ia digunakan untuk kos $ 1 setiap pasangan asas, jadi gen kos satu hingga $ 5, 000 dolar. Sekarang ia turun ke sen setiap pangkalan. Kami hanya memasukkan 100 juta pasangan asas dari Twist [sebuah syarikat DNA sintetik], yang cukup untuk menulis genom ragi sebanyak 10 kali. Ia menjadi lebih mustahil.

Christina-Agapakis-2.jpg Christina Agapakis, pengarah kreatif di Ginkgo Bioworks (Gambar oleh Thatcher Cook untuk PopTech)

Apa sebenarnya yang anda lakukan di makmal?

Ia seperti kilang prototaip pesat. Kita boleh menjalankan banyak variasi laluan yang berbeza dan melihat apa yang berfungsi dalam gabungan yang betul.

Kadang-kadang projek kami bermula dengan pelanggan kami. Mereka akan berkata, "Sukar untuk kami membuat ramuan ini, " dan kami akan mula mencari organisma yang akan menghasilkan sesuatu untuk mereka. Kami mula dari biokimia. Kami mempunyai jurutera teknologi yang memahami biologi sel, dan semua metabolit yang ada di sana, sehingga mereka memahami bagaimana prosesnya mempengaruhi sel-sel.

Jenis projek lain melihat apa biologi yang boleh dilakukan di ruang kimia. [Di sinilah Ginkgo adalah tumbuh-tumbuhan yang tumbuh untuk menyerupai bau yang bertumbuh tinggi.] Bagi bahan-bahan yang kita lihat sekarang, atau bunga atau tumbuh-tumbuhan pada amnya, terdapat beberapa kelas bahan kimia yang boleh membuat sel yang berbeza. Terdapat 1, 000 hingga 5, 000 enzim berbeza. Kami akan katakan, membolehkan mereka mensintesis dan meletakkannya dalam ragi dan melihat apa yang dilakukan oleh varian.

Mengapa anda menggunakan yis sebagai bahan asas?

Ragi adalah hebat, kerana kita sebagai manusia benar-benar baik dalam menapai ragi. Terdapat banyak teknologi di sekitar keupayaan yis untuk mencipta perisa dan bau, kerana bir. Apa yang kita lakukan ialah campuran sains kontemporari dan kaedah pembuatan tradisional. Ketua penapaian kami sebenarnya memiliki kilang bir-Mystic di Chelsea [Massachusetts].

Kelebihan faundri adalah bahawa ia boleh mengautomasikan penjujukan. Kelebihan faundri adalah bahawa ia boleh mengautomasikan penjujukan. (Ginkgo Bioworks)

Apa yang anda sedang kerjakan sekarang?

Terdapat gambarajah Venn yang sentiasa berkembang di mana keupayaan biologi terletak, di mana kejuruteraan boleh dilaksanakan dan di mana terdapat industri, keperluan dan teknologi. Fragrance telah menjadi peneraju, tetapi kami juga mengusahakan teknologi untuk menangkap karbon. Kami mendapat geran Agensi Projek Penyelidikan Lanjutan (ARPA-E) untuk melihat penangkapan karbon dan menukar karbon rantai pendek menjadi perkara yang lebih kompleks. Kami juga bekerjasama dengan Ajinomoto, sebuah syarikat makanan dan kimia Jepun, untuk mengetahui sama ada kami dapat mencari cara untuk meningkatkan aliran sisa mereka.

Apa yang berlaku seterusnya?

Bioworks 2, cawangan yang diperluas, dibuka pada musim bunga atau musim panas awal tahun depan, dan faundri sentiasa bergerak. Kami sentiasa berfikir tentang reka bentuk organisma dan bagaimana untuk menjalankannya dengan lebih cekap. Kami membawa projek baru, pelanggan dan pasaran, tetapi kami juga mengusahakan teknologi.

Sepuluh tahun keluar, kita melihat microbiome, komuniti mikroba dan bagaimana kita boleh membuat insaniah mikroba. Saya menanti masa apabila kita tahu bagaimana mikrob bekerja bersama. Kami juga memikirkan semua perkara yang berbau. Suatu hari nanti kita mahu mempunyai sesuatu yang disebut "100 vials." Ia akan menjadi 100 bau yang berbeza yang dicipta melalui alam semula jadi.

A Boston Biotech Company Is Engineering New Smells