https://frosthead.com

Atlas Sel Manusia Melepaskan Set Data Utama Pertama

Kebanyakan orang telah mendengar Projek Genom Manusia-projek saintifik yang besar untuk menyusun DNA manusia yang memuncak dalam penerbitan kod genetik manusia pertama 2001. Tetapi adakah anda pernah mendengar tentang Atlas Sel Sel Manusia?

Usaha ini melibatkan lebih daripada 480 saintis yang mengerjakan 185 projek untuk mengkatalogkan seluas 37.2 trilion sel dalam badan manusia dengan menjejaki sekurang-kurangnya 10 bilion sel dari semua tisu, organ dan sistem. Dengan mengkaji genetik setiap sel, penyelidik berharap untuk lebih memahami apa yang membuatkan mereka tanda.

Usaha bertahun-tahun ini berjalan lancar. Seperti yang dikatakan oleh Kristen V. Brown di Gizmodo, para penyelidik baru-baru ini menyiarkan kumpulan pertama data yang besar, yang memperincikan 530, 000 sel dari sistem kekebalan tubuh.

Disusun oleh penyelidik di Institut Luas MIT, info itu berasal dari darah tali pusat tali pusat dan sel sumsum dewasa. Mengikut ribuan sel individu, bagaimanapun, bukanlah tugas yang mudah. Menurut siaran akhbar, para penyelidik menggunakan kaedah pengiraan baru untuk mengenal pasti jenis sel dengan cepat dalam data penjujukan serta mengenal pasti cap jari genetik untuk sel yang berbeza. Mereka juga belajar perkembangan selular.

Alat-alat baru ini membenarkan para saintis mengatasi 224, 000 sel sum-sum tulang yang dikumpulkan dari empat pesakit dewasa-kira-kira 100 kali lebih banyak sel kerana kebanyakan eksperimen sel penjujukan sel. Pasukan itu menjejaki bilangan sel yang sama dari darah tali.

"Mengumpulkan dan memproses setengah juta sel kekebalan adalah kecenderungan Herculean, yang melibatkan kerja sama yang ketat dalam pelbagai bidang kepakaran, " kata ahli pasukan Institut Broadle, Danielle Dionne.

Pelepasan data terkini menyertai dua set sebelumnya dari Atlas Sel Manusia: sampel sel 2, 000 dari limpa manusia dan sampel 6, 639 sel dari nodus limfa tetikus. Data setakat sel setengah juta ini adalah magnitud yang lebih besar dan tidak lama lagi akan dilepaskan oleh satu lagi dataset sebanyak 1.08 juta darah tali pusat, sumsum tulang dan sel darah putih yang akan dilepaskan oleh Institut Luas. Satu lagi 250, 000 sel-sel perkembangan manusia juga telah disusun oleh kolaborator Atlas, tetapi belum lagi dipublikasikan.

Secara keseluruhannya, data itu merupakan langkah pertama yang mantap ke arah analisis 10 bilion sel. Matlamat awal Konsortium adalah untuk menghasilkan draf pertama Atlas yang merinci 30 juta hingga 100 juta sel.

Seperti yang diterangkan oleh Steve Connor di MIT Technology Review, Cell Atlas akan mencapai tiga perkara utama. Pertama, ia akan mewujudkan peta 3D super tepat di mana jenis sel yang berbeza berada di dalam tubuh manusia. Ia juga akan mendedahkan gen yang aktif dalam setiap sel, membantu para penyelidik memahami bagaimana tisu berkembang dan beroperasi pada tahap genetik. Dan ketiga, penyelidikan itu kemungkinan akan mendedahkan jenis tisu baru.

Sehingga sekarang, penyelidik telah mengenal pasti kira-kira 300 jenis sel dalam tubuh manusia, termasuk perkara seperti sel lemak dan neuron. Tetapi dalam beberapa tahun kebelakangan ini, analisis molekul baru telah mendedahkan jenis penyelidik tisu yang sebelum ini terlepas, termasuk dua jenis sel retina baru dan sel imun yang baru yang menghasilkan steroid yang menindas imun.

Mungkin Atlas akan menemui lebih banyak jenis tisu baru. "Kami akan melihat beberapa perkara yang kami harapkan, perkara yang kami tahu wujud, tetapi saya yakin akan ada perkara yang benar-benar baru, " kata Mike Stubbington, dari Institut Sanger di UK, yang merupakan seorang kolaborator utama dalam projek itu. "Saya rasa akan ada kejutan."

Matlamat utama Atlas sumber terbuka adalah untuk mempercepat penemuan oleh penyelidik perubatan dan pakar biologi di seluruh dunia, yang akan menggunakan maklumat itu untuk mengkaji perkembangan sel dan mewujudkan era baru perubatan presisi dengan ubat-ubatan dan rawatan yang sangat disasarkan.

Atlas Sel Manusia Melepaskan Set Data Utama Pertama